医学方精品课程—从数据挖掘–MIMIC–R语言基础–R语言作图–R语言高级医学统计–基因编辑–医学统计学,应有尽有。
课程目录
01-GEO、TCGA、Oncomine数据挖掘教程
| 数据挖掘代码
| 课时1 数据挖掘概述.mp4 188.52M
| 课时10 TCGA数据整理和基因注释.avi 212.45M
| 课时11 寻找差异基因和制作5年生存率.avi 340.84M
| 课时12 Oncomine概述及Meta分析.avi 165.33M
| 课时13 Oncomine之差异分析及共表达分析.avi 241.99M
| 课时14 非cel格式GEO芯片数据分析.mp4 49.25M
| 课时2 GEO在线工具的应用.avi 453.44M
| 课时3 GEO数据下载和数据质量分析.avi 124.10M
| 课时4 原始数据预处理.avi 193.68M
| 课时5 寻找差异基因及制作热图和火山图.avi 287.24M
| 课时6 富集分析.avi 268.23M
| 课时7 KEGG分析.avi 221.56M
| 课时8 蛋白互作网络.avi 215.52M
| 课时9 TCGA数据下载.avi 202.76M
02-MIMIC临床数据使用入门
| MIMIC临床数据库使用入门 – 课时1-3.mp4 653.41M
| MIMIC临床数据库使用入门 – 课时4-5.mp4 517.14M
| SQL QUERY.docx 20.09kb
03 R语言可视化及绘图
| 10、10.几何对象之点图.mp4 200.34M
| 11、11.几何对象之条图.mp4 151.29M
| 12、12.几何对象之盒形图和直方图.mp4 183.43M
| 13、13.几何对象之线图.mp4 209.92M
| 14、14.几何对象之标签绘制.mp4 159.91M
| 15、15.坐标轴自定义函数.mp4 250.64M
| 16、16.图例与标题.mp4 336.04M
| 17、17.坐标系转换函数与图片分面函数.mp4 203.70M
| 18、18.主题函数&一页多图&高质量图片导出.mp4 268.03M
| 19、19.venn图和火山图.mp4 165.35M
| 1、1.par函数.mp4 372.94M
| 20、20.nomogram和heatmap.mp4 202.80M
| 21、21.生存曲线.mp4 136.72M
| 2、2.散点图&盒形图.mp4 348.12M
| 3、3.条形图&直方图.mp4 289.30M
| 4、4.饼图&克利夫兰点图&条件图.mp4 135.72M
| 5、5.低级绘图函数(1).mp4 148.91M
| 6、6.低级绘图函数(2).mp4 207.66M
| 7、7.图形颜色选取.mp4 125.59M
| 8、8.ggplot2之qplot.mp4 191.72M
| 9、9.ggplot2之美学函数.mp4 129.82M
| 医学方R语言可视化配套代码.pdf 609.25kb
04-R语言与高级医学统计学
| 1.mp4 43.24M
| 10.mp4 33.94M
| 11.mp4 27.33M
| 12.mp4 69.65M
| 13.mp4 39.54M
| 14.mp4 27.70M
| 15.mp4 41.72M
| 16.mp4 28.95M
| 17.mp4 101.69M
| 18.mp4 49.26M
| 19.mp4 24.28M
| 2.mp4 64.55M
| 20.mp4 34.75M
| 21.mp4 61.85M
| 22.mp4 39.28M
| 23.mp4 72.21M
| 24.mp4 35.98M
| 25.mp4 40.63M
| 26.mp4 34.81M
| 27.mp4 60.56M
| 28.mp4 34.96M
| 29.mp4 34.63M
| 3.mp4 26.30M
| 30.mp4 52.54M
| 31.mp4 54.16M
| 32.mp4 34.73M
| 33.mp4 55.90M
| 4.mp4 45.85M
| 5.mp4 54.24M
| 6.mp4 75.73M
| 7.mp4 60.51M
| 8.mp4 30.01M
| 9.mp4 44.91M
05-豪斯医生数据挖掘之WGCNA详解
| ClinicalTraits.txt 7.29kb
| epr.txt 32.77M
| 课时01.使用cytoscape寻找核心基因.MP4 154.85M
| 课时02.WGCNA理论和算法1.mp4 198.80M
| 课时03.WGCNA理论和算法2.mp4 344.12M
| 课时04.WGCNA理论和算法3.mp4 156.68M
| 课时05.WGCNA理论和算法4.mp4 141.83M
| 课时06.输入文件准备.mp4 349.12M
| 课时07.寻找基因模块.mp4 245.05M
| 课时08.与临床信息相结合.mp4 357.64M
| 课时09.确定核心基因.mp4 299.69M
| 医学方豪斯医生WGCNA配套代码.pdf 126.18kb
06-数据挖掘—miRNA调节网络的构建
| 01、TCGA概述
| 02、构建调控关系理论
| 03、WGCNA理论
| 04、数据下载
| 05、提取蛋白编码基因
| 06、差异分析
| 07、基于算法构建调控
| 08、cytoscape构建网络
| 09、数据库预测
| 医学方miRNA调节网络的构建配套代码
07.医学方医学数据挖掘精品课程-手把手教您如何数据挖掘
| 10.TCGA数据整理和基因注释.mp4 347.76M
| 11.寻找差异基因和制作5年生存率.mp4 592.51M
| 12.Oncomine概述及Meta分析.mp4 323.72M
| 13.Oncomine之差异分析及共表达分析.mp4 401.46M
| 1数据挖掘概述.mp4 193.54M
| 2.GEO在线工具的应用.mp4 300.16M
| 3.GEO数据下载和数据质量分析.mp4 230.52M
| 4.原始数据预处理.mp4 350.56M
| 5.寻找差异基因及制作热图和火山图.mp4 412.54M
| 6.GO富集分析.mp4 379.63M
| 7.KEGG分析(修复).mp4 392.27M
| 8.蛋白互作网络.mp4 306.82M
| 9.TCGA数据下载.mp4 335.94M
| 课程脚本代码.zip 10.02kb
08-医学R语言快速入门与数据清洗
| 01.R语言、Rstudio简介.avi 323.01M
| 02.R包的安装&向量.avi 155.96M
| 03.数值型&逻辑型向量.avi 175.97M
| 04.逻辑表达式&字符串向量.avi 104.45M
| 05.因子型变量.avi 156.56M
| 06.列表&矩阵.avi 136.66M
| 07.数组&初识数据框.avi 123.17M
| 08.数据框.avi 205.85M
| 09.数据框的基本操作.avi 168.21M
| 10.条件与循环.avi 132.56M
| 11.自定义函数&数据读取.avi 219.17M
| 12.数据的读取与写出.avi 137.69M
| 13.数据排序与长宽型数据转换.avi 189.06M
| 14.变量的因子化.avi 109.77M
| 15.apply函数家族.avi 94.40M
| 16.数据汇总函数.avi 140.85M
| 17.plyr包.avi 200.95M
| 18.dplyr包.avi 153.06M
| 19.data.table包.avi 142.52M
| 20.缺失值的识别与处理(1).avi 132.71M
| 21.缺失值的识别与处理(2).avi 168.90M
| 22.异常值和重复值的处理.avi 169.49M
| 23.字符串的处理.avi 219.37M
| 24.正则表达式.avi 163.93M
| 25.stringr & stringi包.avi 213.38M
| 26.时间与日期数据的处理.avi 254.77M
| 27.lubridate包.avi 202.32M
| 28.时间序列简介.avi 103.38M
| 29.时间序列分析.avi 142.97M
| 30.描述性统计.avi 156.57M
| 31.t检验.avi 107.62M
| 32.数据变换.avi 101.40M
| 33.方差分析.avi 194.05M
| 34.卡方检验.avi 108.91M
| 35.回归分析与模型诊断.avi 211.16M
| 36.模型诊断与Logistic回归.avi 118.25M
| 37.生存分析与COX回归.avi 112.36M
| R CODES.rtf 130.46kb